Klopni meningoencefalitis je najredkejša klopno-prenosljiva bolezen v Sloveniji.
Povzročitelj je virus, ki se razmnožuje v slinskih žlezah klopa. Človek za to boleznijo zboli mnogo hitreje kot pes, ki je na klopni meningoencefalitis precej odporen. Od pika do pojava prvih bolezenskih znakov navadno mine od 7 do 14 dni. Kot pri granulocitni anaplazmozi in Lymski boreliozi so tudi tukaj začetni znaki nespecifični. Največ primerov KME mine brez očitnih simptomov. Kadar pa je imunski sistem preslaboten, lahko pride do hudih znakov obolenja centralnega živčnega sistema.
